همانگونه که قبلا اشاره شد در به کارگیری مدلهای کلاسیک DEA معمولا محدودیتهایی وجود دارد بعنوان مثال هرگاه تعداد واحدهای تحت بررسی در مقایسه با مجموع تعداد ورودی‌ها و خروجی‌ها به اندازه کافی بزرگ نباشد، مشکل ضعف قدرت تفکیک رخ می‌دهد. همچنین زمانی که مدل، وزن‌های بزرگی به یک خروجی تکی و یا وزن‌های خیلی